RDA 농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자원 정보시스템. animal gentic resources information management system

Animal Genetic Resources Information Management System

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DNA 정보


  • 유전자원의 유전물질에 대한 정보를 저장합니다. DNA 정보는 마커정보, DNA 서열정보, DNA 변이 정보의 하위 메뉴를 갖습니다.

마커 정보


  • 유전체 정보를 얻기 위한 축종별 마커정보를 입력합니다. 주로 PCR 프라이머의 위치, 서열 등의 정보를 나타냅니다.

마커정보의 등록항목

Items Explanation
마커 식별번호 마커를 식별할 수 있는 고유 식별번호(공란시 자동생성)
마커명 마커의 이름
정방향 서열 PCR을 위한 정방향 프라이머 서열
역방향 서열 PCR을 위한 역방향 프라이머 서열
PCR 산물 크기 해당 프라이머에 대한 PCR 산물의 크기의 범위 (최소 ~ 최대)
PCR 조건 PCR 실험방법의 간략한 설명(anneal 온도, 단계별 시간 등)
UniSTS 식별번호 NCBI UniSTS 식별번호
마커 요약설명 기타 마커에 대한 특이 정보가 있을 경우 입력. 유전자와의 연관, 형질 관련성, 반복서열 등
염색체 마커가 위치한 염색체 번호
프라이머 데이터 공개를 원하시면 체크하십시오.


DNA 서열 정보


  • 개체별, 마커별 서열 분석 결과를 저장합니다.

DNA 서열정보의 등록항목

Items Explanation
개체식별번호 개체정보에 등록되어 있는 개체의 식별번호(저장 전 체크)
DNA 서열 식별번호 DNA 서열을 식별할 수 있는 고유 식별번호(공란시 자동생성됨)
동결자원 정액, 혈액 등의 정보가 있을 경우 해당 동결자원의 식별번호 입력(저장 전 체크)
프라이머 sequencing을 위한 DNA 증폭에 사용된 프라이머 ID
유전자 서열을 결정한 유전자 기호(gene symbol)
GenBank acc. 해당서열을 GenBank에 등록했을 경우 accession number를 입력합니다.
서열 IUPAC code를 이용하여 서열정보를 입력합니다. 단 gap(-)은 입력하지 않습니다. gap이 있을 경우 별도의 서열을 만들어 gap 유무에 따라 두 개의 서열을 입력해 주십시오.
DNA서열 요약설명 서열에 대한 기타 특이 정보가 있을 경우 입력.
공개여부 데이터 공개를 원하시면 체크하십시오.


※ IUPAC Code
Symbol Meaning
G G
A A
T T
C C
R G
Y T or C
M A or C
K G or T
S G or C
W A or T
H A or C or T
B G or T or C
V G or C or A
D G or A or T
N G or A or T or C


DNA 변이 정보


  • 개체별, 마커별 변이(microsatellite, SNP, indel 등) 정보를 저장합니다.

DNA 변이정보의 등록항목

Items Explanation
개체식별번호 개체정보에 등록되어 있는 개체의 식별번호(저장 전 체크)
DNA 변이명 DNA 변이 식별할 수 있는 고유 식별번호(공란시 자동생성됨)
동결자원 정액, 혈액 등의 정보가 있을 경우 해당 동결자원의 식별번호 입력(저장 전 체크)
프라이머 변이 분석을 위한 DNA 증폭에 사용된 프라이머 ID
대립유전자 1 첫 번째 대립유전자형(genotype): 크기(PCR product size), 염기(ATGC-) 등
대립유전자 2 두 번째 대립유전자형(genotype): 크기(PCR product size), 염기(ATGC-) 등
DNA변이 종류 DNA 변이 종류(microsatellite, SNP, indel 등)
요약설명 기타 변이에 대한 특이 정보가 있을 경우 입력.
공개여부 데이터 공개를 원하시면 체크하십시오.